Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SNX13Q9Y5W8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX13Q9Y5W8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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