Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms