Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2CQ9Y4E1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms