Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HECTD4Q9Y4D8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms