Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms