Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms