Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms