Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CIZ1Q9ULV3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms