Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
INO80Q9ULG1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms