Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms