Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms