Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms