Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMEFF2Q9UIK5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEFF2Q9UIK5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms