Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SS18L2Q9UHA2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms