Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms