Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms