Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms