Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms