Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPS7AQ9UBW8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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