Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NLKQ9UBE8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NLKQ9UBE8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms