Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC88CQ9P219 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms