Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms