Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms