Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms