Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMBRD1Q9NUN5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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