Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GINM1Q9NU53 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms