Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTG1Q9NSN8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms