Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX2Q9NRD8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms