Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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