Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC008770.1-204ENST00000489336 622 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms