Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms