Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms