Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms