Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms