Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms