Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF2Q9C093 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms