Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms