Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR2Q9BYE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms