Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF17Q9BXT8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms