Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms