Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-6Q9BXR3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-6Q9BXR3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms