Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRIP3Q9BW71 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms