Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms