Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms