Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CPPED1Q9BRF8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CPPED1Q9BRF8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms