Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms