Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms