Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms