Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms