Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms